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云溪植物园充分利用其优越的生态资源禀赋，保育展示了各类植物1320种(其中国家一级保护植物20种，国家二级保护植物25种)，为华盖木、水松、广西火桐等珍稀濒危植物营造了一个适于生存的新空间。园内的新优花卉、蜜源植物、珍稀植物、野牡丹、睡莲等5个专类展示园，为市民和游客提供了一个了解植物科学奥妙、亲近万千绿意的窗口。

其中，睡莲展示园261个品种的睡莲、荷花竞相绽放，其中有叶片独特的睡莲“狐火”、极具香味的黄睡莲，还有跨越千年绽放的“宋莲”和渡洋回家的“孙文莲”；新优花卉展示园中独树一帜的长叶排钱树和超长花期的大花茄，展示着植物新品种的独特魅力；野牡丹展示园中的82种野牡丹，讲述着由岭南乡野小花变身为城市绿化景观植物的前世今生；蜜源植物展示园中的“榕亭”在光合作用下会慢慢长高，期待市民和游客的见证；而珍稀植物展示园中57株被誉为“植物界的大熊猫”的国家一级保护植物“华盖木”，更是镇园之宝。