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长海医院泌尿外科成立于1951年，是我国成立的第一批泌尿外科专业学科。在新中国泌尿外科奠基人马永江教授及历任科主任的带领下，科室建设不断发展，尤其是近十年期间实现跨越式发展，成为集医、教、研为一体的国际一流、国内领先优势学科。目前科室是国家和上海市重点学科，国家临床重点专科，军队重点建设学科，教育部创新团队“973”牵头单位，科技部“重大新药创制”专项临床评价技术平台，国际泌尿外科学会和首批卫生部示范内镜诊疗技术培训基地，上海市“重中之重”泌尿系统疾病临床医学中心，上海市泌尿系统肿瘤微创及精准诊疗中心跑狗图新一代跑狗论坛，全军前列腺疾病研究所，全军泌尿生殖系统疾病研究重点实验室，全军计划生育优生优育技术研究所。连续九年在中国医院最佳专科排行中名列第二，连续三年获中国医院专科科技影响力排行第一。建科以来，科室以“泌尿生殖系肿瘤、泌尿系结石及微创技术”为主攻方向，在泌尿系肿瘤（肾癌、前列腺癌、膀胱癌）与结石、前列腺疾病、男科、生殖与女性泌尿外科疾病、后腹膜肿瘤、微创泌尿外科技术等领域具有鲜明特色，已形成以转化医学和精准医学为理念的泌尿系统疾病综合研究体系。