UCSF Chimera(分子模拟软件) v1.13.1官方版

UCSF Chimera是一款完全免费的分子模拟软件，用于分子结构和相关数据的交互可视化分析，包括密度图、超分子组合、序列排列、对接结果等。并且可以生成图像和动画。

UCSF奇美拉软件功能

1.它提供了一组有用的特性和清晰的界面。

2.当您第一次启动应用程序时，您会遇到一个几乎简单的主窗口，它只是一个可视面板和一个紧凑的菜单栏，不同于其他通常使用大量工具栏的分子分析工具。

3.因此，为了给分子分析提供一个无干扰的环境，UCSF嵌合体牺牲了一点实用性。它还有一个巨大的文档部分，你应该花一些时间阅读，因为它可以帮助你将学习时间缩短一半。

4.附上一套广泛的可视化和分析工具

说到功能，公用事业提供的东西比你想象的要多。首先，你应该知道它可以产生高质量的图像和动画。它还配有序列查看器，实际上可以让您查找、查看和编辑序列比对。

6.没有什么太复杂的。工具要提到支持交互阴影，变形，Ramachandran图和爆破蛋白。

7.分子分析的有力工具

8.您还应该知道，UCSF Cimeta使您能够更改背景，也就是说，您可以将图形窗口更改为单一颜色、多种颜色的垂直渐变，甚至从计算机加载图像。

9.该实用程序有一个简化的界面，一个巨大的文档，教程和例子，可以帮助您立即开始。一句话，UCSF嵌合体是分子分析的强大应用，包装了许多有用的功能而不用担心。

UCSF嵌合体功能介绍

1.轴、平面和质心的强大功能。轴可以表示为圆柱体，平面表示为圆盘，质心表示为球体，可用于距离和角度测量。

2.体数据：可显示三维电子光学显微镜数据、X射线密度图、静电势等体数据。

3.b因子着色：可以给结构着色以显示属性值

4.筛选分子对接

5.保护着色

6.音量平面显示

7.旋转异构体

UCSF嵌合体的使用

1.通过点击或双击嵌合体图标(取决于其位置)启动嵌合体。通常，这个图标会出现在桌面上。Cimela可执行文件也可以从它们的安装位置运行。

2.闪屏将出现，并在几秒钟内被包含图形显示或最近使用的文件的快速访问列表的主马赛克窗口所取代(这并不重要，因为打开一个结构会自动将显示切换到图形窗口)。如果你喜欢，点击并拖动右下角来放大窗口。也可以通过单击窗口的顶部栏并拖动来移动窗口。

3.打开结构

4.现在打开一个结构。从菜单中选择文件标识获取，并将1ZIK作为结构的标识带出PDB。该结构将出现在图形窗口中。它是由两个肽形成的亮氨酸拉链。

5.默认的初始显示是色带。还显示原子：

6.这显示了结构中的所有原子和键，除了肽链中的那些被条带显示抑制的原子和键。下面讨论如何显示结构的特定部分以进行显示、着色等。最初，杂原子(碳以外的原子)由元素组成：氧原子、氮原子、蓝色等。碳保留了模型的颜色，在这种情况下是黄褐色。

7.隐藏丝带，暴露骨架原子，然后再次显示丝带